中心成立佛法輔導專業培訓中心，為前線社工、輔導員、醫護及教育專業人士提供佛法輔導相關的培訓課程、論壇及研討會。中心亦為專業團體的前線員工安排退修活動，及為大眾就佛法、精神健康及生命教育等主題提供專業課程。
慈山寺佛法心靈輔導中心已於2017年7月通過「香港社會工作者註冊局」的評審，成為主辦持續專業發展的認可活動機構，參加了專業培訓活動及工作坊的社工可獲中心授予持續專業發展學分。
曾舉辦的活動：
- 佛法心靈輔導基礎證書課程
- 精神健康急救標準證書課程
- 「青少年精神健康急救」證書課程
- 「長者精神健康急救」證書課程
- 「靜觀減壓」證書課程
- 「佛學入門課程」
- 「佛法心靈啟迪證書課程」
- 當「接納與承諾治療」遇上《金剛經》講座
- 「心靈的轉化：佛法心靈輔導 (BSC) 與接受與承諾治療 (ACT)的交融」
- 從遺產法中「破地獄」：法律的救贖之路
- 佛法心靈輔導之「療心系列」工作坊
- 慈山寺義工迎新培訓課程
- 「身與心的探戈-四念住初探網上課程」
- 「心靈的淬鍊」佛法心靈輔導經驗分享會
